Die Beschwerden beginnen meistens schleichend. Mit zunehmender Größe des Kalkdepots bildet sich ein subakromiales Impingementsyndrom aus, da die entzündlich verdickte Sehne unter dem Schulterdach eingeklemmt wird. Die Schulterschmerzen werden im Verlauf stärker, wiederholte Schmerzspitzen treten über Monate immer wieder auf. In fortgeschrittenem Stadium kommt es auch zu sogenannten Ruheschmerzen, also zu Schmerzen, die auch ohne körperliche Belastung vorhanden sind. Sie verschlimmern sich nachts, wenn man auf der betroffenen Schulter liegt.

Die Kalkschulter ist selbstlimitierend. Dies bedeutet, dass der Körper den Kalk früher oder später von selbst auflöst. Insbesondere die Phase der Auflösung des Kalks geht mit einer starken Entzündungsreaktion und entsprechend starken Schulterschmerzen einher.